- Prevence a léčba závislosti na tabáku, vedoucí MUDr. Eva Králíková, CSc.
- Dohodovací řízení k Sazebníku zdravotních výkonů, vedoucí MUDr. Hana Cabrnochová
- Léková politika a kategorizace léčiv, vedoucí prof. MUDr. Jan Švihovec, DrSc.
- WMA - regionální úřadovna a mezinárodní styky, vedoucí prof. MUDr. Jaroslav Blahoš, DrSc.
- UEMS (Union Européenne des Médecins Spécialistes), vedoucí prof. MUDr. Jan Škrha, DrSc.
- Metabolické kolegium, vedoucí prof. MUDr. Vladimír Palička, CSc.
- Historie ČLS JEP, vedoucí prof. MUDr. Jaroslav Blahoš, DrSc.
- Pro studium zdravotního stavu obyvatelstva, vedoucí prof. MUDr. Holčík, DrSc.
- Humanitární medicíny, vedoucí doc. MUDr. Leo Klein, CSc.
- Akademie lékařské etiky, vedoucí doc. MUDr. PhMgr. Jan Payne, PhD.
- Osteologická akademie Zlín, vedoucí MUDr. Pavel Novosad
- Prevence rizikového chování, vedoucí Doc. MUDr. Michal Miovský, Ph.D.
- Pro personalisovanou medicínu, vedoucí - prof. MUDr. Vladimír Palička, CSc.
- Rada pro akreditaci klinických laboratoří, vedoucí prof. MUDr. Vladimír Palička, CSc.
(Národní autorizační středisko pro klinické laboratoře ČLS JEP) www.naskl.cz
ČLS JEP | Pracovní skupiny
Při předsednictvu ČLS JEP pracují tyto pracovní skupiny: